作为《生化危机》剧情世界上最强大的商业帝国，保护伞的子公司遍布世界各地，有着极其庞大的规模和错综复杂的体系，公开资料显示，由三个主要部门负责管理，分别是：红伞公司，白伞公司和蓝伞公司。
这三个部门分工明确，各司其职，效率很高，必要的时候“三色伞”也会相互合作，共克难关。
红伞公司（Red Umbrella）是保护伞内部的准军事化部门，拥有大量的安保人员和准军事人员，同时也是计算机研发和资料管理部门，其主要的研发成果就是设计出了顶级人工智能“红后”。
白伞公司（White Umbrella）是保护伞内部的生物研究部门，主要负责与B.O.W（有机生物兵器（Bio Organic Weapon）的缩写，由保护伞公司在浣熊市所培育出来，培养源是T病毒）相关的研究工作，是保护伞公司最重要的一个部门。
除了研究病毒，白色伞还拥有自己的情报机构和强大的间谍网络，其间谍人员会渗透到竞争公司和各个政府机构中窃取情报，并顺手清理那些可能损害公司利益的人。
蓝伞公司（Blue Umbrella）是保护伞内部的B.O.W研发部门，主要负责B.O.W相关的药物与试剂的研究，那各式各样的病毒培养液，均出自蓝伞公司。当然，在绝大多数情况下，蓝伞都会与白伞进行合作。
保护伞公司在世界各地都拥有自己的资产，数量之多，难以统计，尤其是很多固定资产，其建筑规模和用途及保密程度都已达到军事级别：
《生化危机1：变种生还》中的浣熊市地下蜂巢，位于浣熊市地下百米深的地方，是保护伞内部保密程度很高的研究所，主要负责T病毒的研发，拥有数百名工作人员和安保人员，在建筑内部还有很多安全走廊，里面放置着大量杀伤力很强的防御武器，如镭射激光阵等。
《生化危机2：惩罚》中的浣熊市市立医院，是保护伞公司在浣熊市设立的私人医院，规模不小，楼顶还设有停机坪，医院内部还有独立的实验室，可进行改造实验。第一部中的马特被抓走后，就被带到这里，最终沦为“复仇女神计划”的牺牲品。
《生化危机3：灭绝》中的末世大本营的科学部门，这个科学部门位于内华达州的沙漠下方，也是类似蜂巢一般的建筑，只不过这里不光研究T病毒，还研究如何控制丧尸。建筑内部，机关重重，一步踏错就会命丧黄泉，很多爱丽丝的克隆体就是在走廊内寻找出路时，被机关杀死。这里被爱丽丝本体攻占后，解放了所有克隆体，并组建了一支“爱丽丝克隆人军团”，在世界各地与保护伞公司对抗。
《生化危机4：战神再生》中的保护伞（亚洲）总部，总部位于日本东京，也是一座地下蜂巢式建筑，从结构图上看大小应该和其它蜂巢一样，不过内部没有过多的实验室和研究单位，而是驻守了大量的精锐士兵和武器装备。另外还有一艘“阿卡迪亚号”实验货船，这是保护伞公司设在海上的移动堡垒，其内部有先进的生化实验室，可进行生物实验，还存放了大量的步兵战车和V22运输机。用于抓捕和运输幸存者进行活体实验。
《生化危机5：惩罚》中的海底实验场，海底实验场位于北极圈境内，是前苏联时期建造的海底基地，其内部空间十分巨大，不仅存放着数量众多的潜艇，还模拟了许多城市，甚至有一座规模巨大的克隆人工厂，昼夜不停的生产克隆人。克隆人无一例外都是《生化危机》历代记出现的主角团成员。注射各种T病毒变体以及生化寄生虫后，主角团克隆人会突变成强大的B.O.W有机生物兵器。最后的决战就在为自己注射了普拉卡寄生虫（Las Plagas）的莱恩克隆体之间展开。
为了维护公司的利益，保护公司的资产不受侵犯，保护伞公司招募了很多战斗人员，据说人员一度达到数万之多。保护伞用这些战斗人员组建了很多支部队，其中有三支非常有名，分别是特殊作战部队，生物灾害应对部队和危机事件处理部队。
特殊作战部队（Umbrella Security Service，简称U.S.S），是保护伞公司组建的一支精英部队，其成员均由训练有素的职业雇佣兵组成，战斗力非常强悍，主要参与公司的一些秘密行动。因为身份特殊，所以这支部队的保密级别很高，就算是在保护伞内部，也只有极少数的人知道这支部队的存在。
生物灾害应对部队（Umbrella Biohazard Countermeasure Service，简称U.B.C.S），是为了应对生化危机而组建的一支武装部队，主要职责是在生化武器发生泄漏后，及时开展营救工作，前往污染区，拯救幸存者，铲除生化武器造成的危害，保护公司高层雇员以及转移公司重要资产。
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